O acervo do Arquivo Histórico João José Planella do IHGPEL formou-se a partir de doações de familiares de cidadãos (âs) que se destacaram no desenvolvimento de Pelotas, RS e Brasil. Desde 1982, ano de sua fundação, o IHGPEL vem recebendo livros, documentos e reálias.
O Arquivo Histórico conta com os seguintes Fundos:
001 – Fundo Ministro Alexandre Cassiano do Nascimento
002 – Fundo Manoel Lourenço do Nascimento
004 – Fundo da Câmara Municipal de Pelotas
005 – Fundo José Anélio Saraiva
006 – Fundo Liga Pelotense de Futebol
007 – Fundo Professor Mario Osorio Magalhães
008 – Fundo Alda Maria Jaccotted
009 – Fundo Major Ângelo Pires Moreira
Além da organização em fundos, o IHGPEL disponibiliza aos pesquisadores, documentos variados como jornais antigos, almanaques, revistas, entre outros.